小説SNSのpixiv novelとnovelist.jpを実際に使って比べてみました。
投稿者視線なので、純閲覧者には興味のないネタだと思います。

ジャンルとか初動（新規作品としてトップページに載っている状態）とか
●pixiv novel
・オリジナルは初動閲覧0で流れても珍しくないので二次創作向け
●novelist.jp
・入り口からオリジナルと二次創作に分かれている
・ユーザーが少ないので初動が長いが、そもそも最大閲覧数もあまり伸びない。

閲覧
●pixiv novel
・モバイル対応でアプリもある
・イラスト系のユーザーとも絡みたいなら確実にこっち
●novelist.jp
・PCのみ対応なのでツイッターで宣伝を見てもそのまま閲覧できない人が多い

細かい仕様
●pixiv novel
・本文中にURLを貼ると自動的にハイパーリンクになる。
novelistでは平文扱いなので長編のリンク貼りが面倒。
●novelist.jp
・pixivでは有料会員にしかできないキャプションの改行、表紙絵の訂正ができる。
・会員でなくても（ユーザー登録していなくても）閲覧できるがやっぱりpixivの人数にはかなわない
・3000文字以内の一番最後で強制改ページされる

交流
●pixiv novel
・人気のある作品でもコメントがつきにくい。匿名にしたいのかタグでコメントがつく。
●novelist.jp
・mixiのように足跡システムがあり、結構な確率で
「閲覧ありがとう！」「ブクマありがとう！」というコメントが来る。
・コミュニティもありますがそもそもユーザーの数が（以下略

あと思い出したことがあったら適宜追加していきます。